申报缴税规则的主要变化为：
1、 经过税费境外投资批准证书 境外投资备案 境外投资备案申请条件 境外投资认定后才能进行纳税申报：企业所得税、个人所得税（包括扣缴个税和生产经营所得个税）、增值税（消费税）附加税费要有有效的税费种认定，才能进行纳税申报，您可以通过涉税查询的“登记信息查询－税费种认定信息”功能查询已认定的税费种信息。如果您没有有效的税费种认定信息，请联系主管税务机关。
2、按期申报的税种每期只能申报一次：增值税（消费税）附加税费按月(季)申报、企业所得税季度(年度)申报、个人所得税生产经营所得季度(年度)申报、个人所得税按月扣缴工资薪金所得等按期申报的税种，在金三系统中每期只能申报一次，如果您有申报错误且已经缴纳税款，或者需要补申报的，请前往办税服务厅进行申报更正。
3、附加税费申报：根据国家税务总局《关于合理简并纳税人申报缴税次数的公告》（国家税务总局公告2016年第6号）规定，随增值税、消费税附征的城市维护建设税、教育费附加免于零申报。如果本属期内您已经在深圳国税进行了增值税、消费税的零申报，则无需进行附加税费的申报，附加税费的未申报信息也会自动比销。
附加税费未达起征点的减免需要手工选择减免性质并录入减免金额。
4、房产税申报变化：从价计征的房产税按季度申报，且一次操作完成所有房产的申报。如果以前已经有按月申报信息的，2016年第三季度申报时会自动计算剩余月份的税额。如果因为税源登记信息不准确而导致申报错误的，请前往财产所在地税务机关修改您的税源登记信息并进行更正申报。从租计征的房产税需经税务机关进行税种认定后按月申报。
如果您应享受房产税减免而系统未自动计算减免，也需要到税务机关变更税源登记的减免信息。
5、城镇土地使用税申报变化：城镇土地使用税按半年申报，且一次操作完成所有土地的申报。如果以前已经有按月申报信息的，2016年下半年申报时会自动计算剩余月份的税额。
如果您应享受城镇土地使用税减免而系统未自动计算减免，也需要到税务机关变更税源登记的减免信息。
6、扣缴外国企业税收报告表变化：金税三期扣缴外国企业所得税报告表只能进行企业所得税的扣缴，且需要有税种认定信息。代扣代缴增值税（消费税）附加税费、代扣代缴印花税的，目前只能到地税办税服务厅办理。
7、个人所得税生产经营所得申报变化：申报时税款所属期应从本年度1月起至申报季度末（如2016年1月－2016年9月），申报时各项数额填写年度累计数。本年度新开业纳税人的税款所属期起为开业经营月份（如5月份开业的纳税人，属期从2016年5月－2016年9月）。根据金三规则，个人所得税生产经营所得以自然人为纳税主体，缴纳税款时需要按自然人逐一缴纳，暂时不能用企业的银税协议扣缴个人，建议纳税人在电子税务局上使用网银缴税或者缴税。
个人所得税生产经营所得的投资方需要在金三系统进行自然人登记。如果提示您未做登记的，请通过自然人电子税务局，或者关注深圳地税公众号，自助开通自然人用户；或者前往办税服务厅办理自然人登记 。
8、电子税务局申报和缴税差错处理变化：已申报未缴款的申报表可以在电子税务局作废；已申报并缴纳税款的申报表，不能在电子税务局作废缴款和申报表，请前往办税服务厅办理缴款作废或申报更正事项。
通过银税协议缴税的在每个工作日中午12：00前，可以作废工作日12：00－当天11：59的协议扣款；通过网银和缴税的只能在当天办理作废。
9、 暂不支持逾期申报：金税三期暂不支持电子税务局逾期申报，如有逾期到办税服务厅申报。请您妥善安排时间，在申报期限前完成申报。
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